川觀新聞記者?鐘帆
4月17日,在成都舉行的第三屆“千種本草基因組計劃”會議上,,由成都中醫(yī)藥大學(xué)本草基因組學(xué)團(tuán)隊聯(lián)合現(xiàn)代中醫(yī)藥海河實驗室,、中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院藥用植物研究所、東北林業(yè)大學(xué),、湖北時珍實驗室等單位共同完成的全球首個億量級草藥基因編碼天然多樣性成分庫(GNDC)發(fā)布,。作為目前全球規(guī)模最大的藥用天然成分庫,GNDC將為藥物發(fā)現(xiàn)提供廣闊的“化學(xué)空間”,,加速“大數(shù)據(jù)驅(qū)動”模式下的藥物發(fā)現(xiàn)進(jìn)程,。

活動現(xiàn)場
這個草藥基因編碼天然多樣性成分庫有何意義?
GNDC基于全球八大權(quán)威藥典收錄的1037個藥用物種的核基因組,、細(xì)胞器基因組等多維數(shù)據(jù),,一方面通過自主開發(fā)的基因組遍歷算法結(jié)合轉(zhuǎn)錄組、小RNA測序,、肽質(zhì)譜等多組學(xué)技術(shù),,實現(xiàn)了對天然多樣性成分的挖掘與驗證;另一方面通過整合自然語言處理,、對抗生成網(wǎng)絡(luò),、圖卷積網(wǎng)絡(luò)等人工智能算法,實現(xiàn)成分的識別,、分類與功能注釋,。
以基因之“鑰”解鎖本草之“謎”。GNDC收錄了超過2.34億個基因直接或間接編碼的天然多樣性成分,,包括232萬個次生代謝產(chǎn)物,、22977萬條多肽,、238萬個小RNA和26萬個碳水化合物。它實現(xiàn)了基因組信息,、成分信息與功能信息的整合,,彌補(bǔ)了現(xiàn)有天然產(chǎn)物數(shù)據(jù)庫在數(shù)據(jù)類型與功能解析方面的不足。
在項目總負(fù)責(zé)人中國工程院院士,、成都中醫(yī)藥大學(xué)首席教授陳士林看來,,GNDC實現(xiàn)了基因組數(shù)據(jù)與人工智能算法的深度融合,標(biāo)志著天然成分研究進(jìn)入了智能化和精準(zhǔn)化的新階段,。通過創(chuàng)新性整合多組學(xué)技術(shù)與人工智能方法,,GNDC在天然多樣性成分的識別、分類與功能注釋方面展現(xiàn)出了突破性優(yōu)勢,,將成為驅(qū)動天然藥物研發(fā)范式變革,、加速中藥現(xiàn)代化進(jìn)程的核心技術(shù)支撐。
(圖片由成都中醫(yī)藥大學(xué)提供)
編輯:陳翠
責(zé)任編輯:余鳳
編審:張宏彥
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